Radioanatomie · TDM thoracique
TDM thoracique injectée
Un atlas à parcourir coupe par coupe, de l'orifice supérieur du thorax aux coupoles : axial en fenêtres médiastinale et parenchymateuse, coronal et sagittal, structures légendées en français et colorées par catégorie, lobes pulmonaires colorés, mode quiz. Chaque étiquette est vérifiée sur des segmentations relues par des radiologues.
Comment l'utiliser
- Séries : axiale en fenêtre médiastinale (vaisseaux, cœur, médiastin) et en fenêtre parenchymateuse (bronches, scissures, lobes), coronale et sagittale.
- Changer de coupe : molette, flèches du clavier, curseur, ou glisser le doigt verticalement sur l'image. Les coupes axiales défilent de haut en bas, comme à la console.
- Lobes : les 5 lobes colorés, scissures soulignées en blanc ; un bouton les masque pour lire le parenchyme.
- Catégories : chaque catégorie s'affiche ou se masque par un interrupteur.
- Quiz : les noms sont remplacés par « ? » ; touchez une étiquette pour révéler la structure.
Code couleur
- Poumons et scissures
- Voies aériennes
- Artères
- Veines
- Cœur
- Viscères et glandes
- Muscles
- Système nerveux
- Os et cartilages
Lobes colorés : supérieur droit, moyen, inférieur droit, supérieur gauche, inférieur gauche. Convention radiologique : en axial et en coronal, la droite du patient est à gauche de l'écran (lettres D et G) ; en sagittal, l'avant est à gauche.
D'où viennent les étiquettes
- Segmentations de référence (71 structures) : trachée, œsophage, thyroïde, lobes, aorte et ses branches, veines caves et brachiocéphaliques, veines pulmonaires, auricule gauche, côtes et vertèbres numérotées, sternum, scapulas, clavicules, moelle spinale, muscles érecteurs du rachis, foie, estomac, rate. Ces masques ont été relus et corrigés par des radiologues (jeu TotalSegmentator) ; chaque étiquette est posée au point le plus intérieur de la structure sur la coupe.
- Structures calculées (18) à partir de ces masques et du scanner : aorte ascendante, arc, aorte thoracique descendante puis aorte abdominale sous le hiatus (disque T12-L1) ; carène et bronches principales (le masque « trachée » de référence se divise en deux à la bifurcation, en regard de T5) ; scissures (interface entre deux lobes) ; hiles ; apex et bases ; veines pulmonaires droites et gauches.
- Repères manuels (10) pour ce que la référence ne contient pas : tronc et artères pulmonaires, les 4 cavités cardiaques (séparées sur leur densité : en phase mixte, le cœur droit est opacifié par le bolus), veine azygos, grands pectoraux. Chacun des 212 points est contrôlé : densité attendue, et pas dans le masque d'une autre structure ; cavités et arbre pulmonaire dans le masque du cœur.
- Non légendés faute d'être visibles de façon sûre à 1,5 mm : artères thoraciques internes, nerfs vagues et phréniques, crosse de l'azygos, segments pulmonaires (sans arbre bronchique segmentaire validé, seuls les 5 lobes sont montrés).
Contrôles automatiques (rapport) : côtés (foie à droite de la rate), arc aortique à gauche de la trachée, veine cave supérieure à droite de l'aorte ascendante, carène en regard de T4–T6, bronche principale gauche plus longue que la droite, chaque côte de la 2e à la 10e articulée avec sa vertèbre, lobe moyen en avant du lobe inférieur, densités de la phase injectée (aorte, veine cave supérieure, veines pulmonaires, cœur).
Source et licence
Images et segmentations de référence : « Dataset with segmentations of 117 important anatomical structures in 1228 CT images », version 2.0.1 (Wasserthal J. et al., TotalSegmentator, Hôpital universitaire de Bâle), doi:10.5281/zenodo.10047292, licence CC BY 4.0 (mention). Scanner de routine clinique anonymisé, cas s0310 : femme de 23 ans, TDM cervico-thoracique injectée, sans pathologie selon les métadonnées du jeu de données ; phase mixte vérifiée sur les densités (aorte 165 UH, veines pulmonaires 156 UH, cœur 168 UH) ; voxels de 1,5 mm.
Modifications par RadiologicHub : coupes axiales, coronales et sagittales orientées selon la convention radiologique, fenêtrage, recadrage sur le patient, agrandissement × 2, calque des lobes, étiquettes en français posées comme décrit ci-dessus.
Données et scripts : radioanatomie/donnees/thorax-tdm/, scripts/radioanatomie/preparer_tdm_thorax.py, scripts/radioanatomie/construire_atlas_thorax.py.